AlphaFold 단백질 구조 DB

 딥마인드가 얼마전에 AlphaFold의 소스코드를 공개했었는데 이번에는 AlphaFold Protein structure Database라는 예측 단백질 구조 DB를 공개했다. 페이지 생긴건 꼭 NCBI의 그것과 비슷하게 생겼다. 현재는 휴먼이랑 20가지 organism에 대한 정보들을 제공하는 것 같다.

* url : https://github.com/deepmind/alphafold, https://www.alphafold.ebi.ac.uk/

지난 학기 분자생명공학 수업 팀프로젝트에서 다루었던 Hero7 ptn을 검색해보았는데 당시에 RaptorX Protein structure prediction으로 예측했던 구조와 DB에 나온 구조가 꽤 달라서 조금 당황스러웠다. 

Raptor X로 예측한 구조

AlphaFold가 예측한 구조

DB 참조 : https://www.alphafold.ebi.ac.uk/entry/Q9VEW2

단백질 길이가 짧아서 비슷하게 결과가 나올줄 알았는데 아니었다

알파폴드가 틀렸을 수도 있지만 Hero7이 아령 모양이 아니었다니 충격..

재미있게 보았던 SF 영화 소개

1. 매트릭스 시리즈 (1999, 2003)

#가상현실

2. 인셉션 (2010)

#꿈

3. 인터스텔라 (2014)

#우주

4. 테넷 (2020)

#시간

5. 가타카 (1997)

#유전공학

6. 토탈리콜 (1990)

#가상현실

7. 소일렌트 그린 (1973)

#디스토피아

8. 더 랍스터 (2015)

#디스토피아

9. 13층 (1999)

#가상현실

10. 레디 플레이어 원 (2018)

#가상현실

11. 에일리언 (1979)

#외계인 #우주

12. 블레이드 러너 (1982)

후속작인 블레이드 러너 2049도 있습니다

#인조인간

13. 혹성탈출 시리즈 (1968) - 리메이크 포함

#우주

14. 스타워즈 시리즈 (1977-)

#우주

15. 2001 : 스페이스 오디세이 (1968)

#우주 #AI

16. 이디오크러시 (2006)

#디스토피아

17. 12몽키즈 (1995)

#질병 #디스토피아

18. 스캐너 다클리 (2006)

#마약 #디스토피아

19. 공각기동대 (1995)

#전뇌

20. 브라질 (1985)

#디스토피아

21. 터미네이터 1, 2 (1984, 1991)

#로봇 #AI

22. Her (2013)

#AI #로맨스

23. 칠드런 오브 맨 (2006)

#디스토피아

*생각이 난 대로 적었기 때문에 적힌 순서는 의미가 없습니다

몇몇 영화에 태그를 더 달고 싶었는데 스포가 될 것 같아서 적지 못했습니다 크크

나의 소개 (about me)

 

성염색체와 관련된 흥미로운 사실들

 1. 개미의 성 결정은 염색체 배수성에 의해 결정된다

개미의 성 결정 방식은 정말 이상하다. 여왕 개미가 알(난자)을 낳아서 그 알이 수정이 되지 않은 채로 자라면 수컷 개미가 된다. 즉 암컷 개미(여왕 개미와 일 개미)의 핵상은 2n(diploid)인데 수컷 개미의 핵상은 n(haploid)이다. 수컷 개미의 세포가 체세포 분열을 해서 정자가 만들어지면 여왕 개미의 난자와 결합하여 다시 암컷 개미가 된다.

 2. 여자의 체세포는 서로 다른 성 염색체가 발현된다

여성은 남성과 다르게 X 염색체를 두 개 가지는데 두 X 염색체 중 한 가지는 비활성화(heterochromatin)된다. 이러한 비활성화는 포배기에 배아줄기세포가 Xist라는 유전자에 의해서 X 염색체가 메틸화되어 일어난다. - 비활성화된 염색체는 바소체라고 부른다 - 이 때 배아줄기세포 마다 비활성화되는 X 염색체가 다르게 선택되기 때문에 분화가 진행되어 완전하게 사람이 되었을 때 몸 곳곳에 존재하는 체세포의 (유전자를 발현하는데 사용되는)X 염색체가 다르게 나타난다.

3. 3색 고양이는 암컷이다

고양이의 털 색(황금색, 검은색)을 나타내는 유전자가 사람으로 따지면 X 염색체에 존재하기 때문에 3색이 모두 존재하는 고양이는 암컷 고양이이다.