딥마인드가 얼마전에 AlphaFold의 소스코드를 공개했었는데 이번에는 AlphaFold Protein structure Database라는 예측 단백질 구조 DB를 공개했다. 페이지 생긴건 꼭 NCBI의 그것과 비슷하게 생겼다. 현재는 휴먼이랑 20가지 organism에 대한 정보들을 제공하는 것 같다.
* url : https://github.com/deepmind/alphafold, https://www.alphafold.ebi.ac.uk/
지난 학기 분자생명공학 수업 팀프로젝트에서 다루었던 Hero7 ptn을 검색해보았는데 당시에 RaptorX Protein structure prediction으로 예측했던 구조와 DB에 나온 구조가 꽤 달라서 조금 당황스러웠다.
Raptor X로 예측한 구조
AlphaFold가 예측한 구조
DB 참조 : https://www.alphafold.ebi.ac.uk/entry/Q9VEW2
단백질 길이가 짧아서 비슷하게 결과가 나올줄 알았는데 아니었다
알파폴드가 틀렸을 수도 있지만 Hero7이 아령 모양이 아니었다니 충격..
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